采用硫磺熏蒸药材品种的选中及其熏蒸程度的判断，是依据药材的理化性质决定的。传统上会使用硫磺熏蒸的中药材包括：
（1）粉性足的药材。常为富含淀粉等多糖类物质的肥大根及根茎，在生产加工工程中使用硫磺熏蒸可防止褐变或利于干燥，使其品相美观或质地硬实，还可防止其在流通贮藏果真中滋生虫害和霉变。如山药、粉葛、粉防己、党参、白芷、白芍、白术、当归、川芎、明党参、南沙参、泽泻、贝母等。
（2）动物性药。常为富含蛋白质、脂肪、氨基酸类德哥营养物质的动物组织器官。使用硫磺熏蒸可防止其在加工。流通贮藏过程中出现虫害和变质，并延长保质期。如海马、海龙、土鳖虫、水蛭、鹿鞭、海狗肾、骨类和角类药材等。
（3）花类药材。常富含香味物质和各类营养成分，吸引昆虫和产生虫害，易霉变和褐变。使用硫磺熏蒸可防虫、杀虫，并使其品相美观，还可延长保质期。如金银花、菊花等。
（4）其他一些茎木皮类、果实种子类药材。
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